miércoles, 19 de agosto de 2009

TALLER

UNIVERSIDAD DEL QUINDIO
FACULTAD DE CIENCIAS BÁSICAS
PROGRAMA DE BIOLOGÍA

Adaptado por Nelson Enrique Arenas Suárez

TALLER # 1
PROTEÍNAS Y ENZIMAS


Las enzimas son catalizadores biológicos de los organismos vivos que se caracterizan por su eficiencia catalítica; así como por su especificidad en su sustrato y reacción en la que participa. Con la excepción de ciertas moléculas catalíticas de ARN, las enzimas son proteínas, o en algunos casos proteínas más compuestos o iones auxiliares que reciben el nombre de cofactores.


Cuál es la composición de las proteínas? Y el contenido de Nitrógeno?
Dibuje la estructura de un aminoácido e identifique los 2 grupos funcionales constituyentes, el carbono, el hidrogeno y el grupo R o cadena lateral.
Por qué se llaman aminoácidos?
Realice una tabla donde clasifique los aminoácidos según su R. Diferencie los aminoácidos básicos, ácidos y aromáticos.
Qué es un isómero? Y qué es un carbono asimétrico o quiral?
Qué diferencia fundamental existe entre la forma no disociada y la forma bipolar de un aminoácido?
Qué importancia específica tienen los L-aminoácidos?
Qué es una enzima?
Que es un complejo enzima-sustrato y qué importancia tiene?
Qué es un centro activo? Defina algunas de sus características?
A que se denomina reconocimiento por adaptación inducida?
Defina los siguientes términos: holoenzima, apoenzima y coenzima.
Cuántas clases de enzimas hay; como se caracterizan?
Defina la inhibición enzimática irreversible.
Que es un inhibidor competitivo.
Explique, brevemente, la distinción entre las inhibiciones competitiva y no competitiva.
Qué es un enzíma alostérico?
Qué es un zimógeno?

miércoles, 12 de agosto de 2009

TEORIA CELULAR

BRIEF HISTORY
1665- Robert Hooke employed “CELL” concept for the first time.
1824- René Dutrochet extended cellular concept to structural unit.
1838 Mathias Schleiden (plants) and Theodor Schwann (animals) proposed that all living things are made of cells.
1858, Rudolf Virchow established that all cells come from others cells (axioma "ommni cellula e cellula").

CELLULAR THEORY
§ The cell is the smallest structural and functional unit capable of carrying out life processes.
§ Cells are the living building blocks of all plant and animal organisms.
§ The functional activities of each cell depend on the specific structural properties of the cell.
§ All organism’s structure and function ultimately depend on the capabilities of its cells.
§ All new cells and new life arise only from pre-existing cells.
§ Because of this continuity of life, the cells of all organisms are fundamentally similar in structure and function.

Characteristics of All Cells
• A surrounding membrane
• Cytoplasm – cell contents in thick fluid
• Control center with DNA

PROKARYOTIC CELLS
Eukaryotic Cells
First cell type on earth
Kingdoms: Eubacteria and Archaeabacteria
No membrane bound nucleus
Nucleoid = region of DNA concentration
Organelles not bound by membranes
VERY small
Nucleus bound by membrane
Kingdom: fungi, protists, plant, and animal cells
Possess many organelles (structures Bound by
membranes)

EUKARYOTIC CELLS
Mitochondrion: An important cell organelle involved in respiration.
Cytoplasm: A fluid surrounding the contents of a cell and forms a vacuole.
Golgi Apparatus: The processing area for the creation of a glycoprotein.
Endoplasmic Reticulum: An important organelle heavily involved in protein synthesis.
Vesicles: Packages of substances that are to be used in the cell or secreted by it.
Nucleus: The "brain" of a cell containing genetic information that determines every natural process within an organism.
Cell Membrane: Also known as a plasma membrane, this outer layer of a cell assists in the movement of molecules in and out the cell plays both a structural and protective role.
Lysosomes: Membranous sacs that contain digestive enzymes.
Cell Wall: A structure that characteristically is found in plants and prokaryotes and not animals that plays a structural and protective role.

In and Out - getting things into and out of cells

Active Transport - Active transport is the transport of molecules with the active assistance of a carrier that can transport the material against a natural concentration gradient.
Passive Transport (Diffusion) - The movement of molecules from areas of high concentration (i.e. outside a cell) to areas of low concentration (i.e. within a cell) via a carrier. This process does not require energy.
Simple Diffusion - The movement of molecules from areas of high concentration to areas of low concentration in a free state. Osmosis of water involves this type of diffusion through a selectively permeable membrane (i.e. plasma membrane).

The Breakdown of Materials in a Cell

In cells, sometimes it is required to breakdown more complex molecules into more simple molecules, which can then be 're-built' into what is needed by the body with these new raw materials.

'Pinocytosis' where to contents of a structure (such as bacteria) are drank, essentially by breaking down molecules into a drinkable form.

'Phagocytosis' where contents are 'eaten'. See cell defence for more information in regards to this.

Absorption and Secretion
Absorption is the uptake of materials from a cells' external environment. Secretion is the ejection of material.

MICROSCOPY

Cells are too small to see by the naked eye
Antony van Leeuwenhoek (1632-1723) - developed some of the earliest microscopes
Modern Microscopes
Bright Field, Fluorescence, Phase Contrast, Dark Field, Differential Interference, Digital Video Microscopy, Confocal, 2 photon confocal, spinning disc confocal, total internal reflection fluorescence (TIRF),
Electron Microscope (EM)
Transmission, scanning, scanning tunneling
Magnetic Resonance Imaging (MRI)

Modern Cell Biology

Arose from 3 separate fields becoming interwoven over the last 50 years
Cytology
Biochemistry
Genetics

Cytology
Oldest branch
Dependent on optical techniques
1870 invention of microtome for sectioning biological specimens
Light Microscope
Biochemistry
1828 Freidrich Wohler showed urea synthesis from ammonium and cyanate (organic compounds synthesized from inorganic compounds)
biological chemistry (biochemistry) the same as all other chemistry
1868 Louis Pasteur shows yeast cells needed for fermentation of sugar into alcohol (living organisms for specific chemical processes)
1897 Hans Buchner shows that extract from yeast cells also works (enzymes)
1920’s-30’s Biochemical pathways (glycolysis, Krebs cycle (TCA), ATP for energy)
Genetics
1866 Gregor Mendel hereditary factors (genes) and segregation (took 35 years before work recognised)
1876 Walther Flemming identified chromosomes
1900 Walter Sutton chromosome theory of inheritence
1944 Avery et al. genetic transformation in Bacteria)
1953 James Watson and Francis Crick double helix model

TECNICAS DE BIOLOGIA CELULAR

http://homepages.gac.edu/~cellab/index-1.html

sábado, 1 de agosto de 2009

ENLACES DE INTERES

http://legacy.lclark.edu/~reiness/cellbio/lectures/lectures.htm
http://cellbiologypowerpoints.googlepages.com/home
http://temas-biologiacym.blogspot.com/
http://www.isftic.educacion.es/w3/eos/MaterialesEducativos/mem2001/biologia/index.html
http://biologica.concord.org/index.html
http://webcast.berkeley.edu/course_details_new.php?seriesid=2009-B-58324&semesterid=2009-B

PROGRAMA DE BIOLOGIA CELULAR

UNIVERSIDAD DEL QUINDIO
FACULTAD DE CIENCIAS BÁSICAS Y TECNOLOGICAS
PROGRAMA DE BIOLOGIA CON ENFASIS EN BIODIVERSIDAD

2009

IDENTIFICACIÓN

Biología Celular: esta asignatura es una actividad académica básica presentada en el I semestre 2009.
Esta asignatura es de tipo teórico-práctica contiene 4 créditos académicos, 112 horas son de acompañamiento directo y 80 de trabajo independiente durante las 16 semanas de duración del semestre académico
Horarios de clase: Jueves de 4 pm a 6 pm (Aula 303) y viernes de 7 a 9 am (Aula 107)
Las asesorías se realizarán en la sala de profesores de biología previa cita via e-mail.
Profesor: Nelson Enrique Arenas Suarez Lc, MSc correo: nelson.arenas@gmail.com

MISIÓN

El programa de Biología formará profesionales íntegros, competitivos en su disciplina de conocimiento y comprometidos con el desarrollo de la comunidad en los aspectos sociales, políticos, económicos y ambientales.

VISIÓN

Para el año 2015 el programa de Biología con énfasis en biodiversidad será reconocido por su calidad académica y científica, mediante la generación y difusión de conocimiento relacionado con los componentes ambientales, cuya aplicación contribuya al mantenimiento y conservación de los ecosistemas.

PROPÓSITO GENERAL DEL PROGRAMA

El Programa de Biología con énfasis en Biodiversidad, desarrollará actividades y proyectos de investigación con instituciones públicas y privadas que permitan generar el conocimiento necesario para aportar alternativas de solución a la situación ambiental, regional y nacional.
El currículo del programa de Biología de la Universidad del Quindío, se fundamenta en la transversalidad e integralidad de todas las actividades académicas (básicas, profundización, profesionales, obligatorias de ley e institucionales) y está acorde con la pertinencia y relevancia de la investigación básica y aplicada con relación a los elementos de la biodiversidad (suelo, agua, fauna y flora); como también con la proyección social para la protección, conservación y restauración de los componentes ambientales.
El currículo responderá al principio de flexibilidad y por ende será dinámico y cambiante, acorde a las variables ambiental, social, política y económica que se presenten a nivel regional, nacional e internacional.

OBJETIVOS DEL PROGRAMA

1. Orientar el proceso de formación académica, científica y tecnológica con base en el respeto por los derechos humanos y de las distintas formas de vida, la democracia y el mejoramiento cultural.
2. Impulsar la modernización curricular orientada hacia la excelencia académica.
3. Formar biólogos en investigación básica y aplicada relacionada con la diversidad biológica.
4. Formar biólogos para el diseño, formulación y ejecución de programas encaminados a fortalecer políticas ambientales, a nivel regional, nacional e internacional.
5. Promover y consolidar semilleros, grupos y líneas de investigación.
6. Articular el conocimiento generado a los procesos y necesidades de las poblaciones locales.

OBJETIVOS DEL ESPACIO ACADEMICO

1 Estudiar la estructura morfológica en relación a la fisiología de la célula eucariota.
2 Estudiar los aspectos celulares de la evolución, homeostasis, regulación y relación entre los tipos celulares componentes de órganos y tejidos en macroorganismos.
3 Generar espacios de discusión con visión crítica entre los aspectos teóricos y prácticos en la biología de la célula eucariota.
4 Introducir al lenguaje de la biología términos y conceptos celulares partir de la explicación de su origen e importancia.
5 Explicar y poner en contexto las técnicas más importantes que han permitido el entendimiento del funcionamiento celular.

RELACIÓN DEL PROPÓSITO DEL PROGRAMA Y LOS OBJETIVOS DE LA ACTIVIDAD ACADÉMICA

La biología celular se define como la ciencia que se ocupa del estudio de las bases moleculares de la vida; es decir, relaciona las estructuras de las biomoléculas con las funciones específicas que desempeñan en la célula y en el organismo, así como los procesos encargados de la diferenciación celular para la formación de órganos y tejidos y la relación entre ellos en los diferentes tipos de organismos.

JUSTIFICACIÓN DEL ESPACIO ACADÉMICO

La biología de las células es un área de investigación activa cuyo entendimiento es fundamental para todas las ciencias biológicas. Como ciencia básica es el punto partida para el entendimiento del funcionamiento de la vida y corresponde actualmente al área de mayor crecimiento del conocimiento biológico de las relaciones entre organismos con aplicaciones prácticas de interés en medicina, bioquímica, biotecnología entre otras.

COMPETENCIAS FORMATIVAS

Se pretende desarrollar competencias personales en cuanto a la comprensión de textos y metodologías usadas en las áreas de estudio de la célula, fomentar el trabajo en grupo y el autodidacta frente a la búsqueda de información y análisis de datos experimentales.
Potenciar el desarrollo de estructuras mentales de interacción de conceptos celulares con la promoción de la salud y la innovación tecnológica e industrial.

METODOLOGÍA

Actividades de trabajo presencial: clase magistral, talleres en clase, revisión y discusión de artículos, exámenes cortos, seminarios de grupo y una revisión sustentada de tema.
Actividades de trabajo independiente: obtener de diferentes fuentes la información necesaria para el entendimiento de las investigaciones realizadas en el área de la biología celular.

EVALUACIÓN

v Cuatro exámenes parciales de los temas tratados en clase con valor de 15% cada uno
v Cuaderno y un examen parcial de los temas tratados en el laboratorio con valor de 15% ambos
v Quizes acerca de los artículos y temas de revisión, valor 10% todos
v Un trabajo final escrito y sustentado oralmente como seminario de tipo grupal con valor de 15%.

Nota: En el seminario grupal todos preparan el tema pero solo un estudiante lo expone, los estudiantes son responsables de reservar con tiempo los equipos necesarios para sus presentaciones.